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Wie ein Forscher Codex und ChatGPT nutzt, um neue antimikrobielle Moleküle zu entdecken

· Quelle: OpenAI Blog

Das von César de la Fuente geführte Labor nutzt die KI‑Modelle von OpenAI – Codex und ChatGPT – um aktuelle und ausgestorbene Genomdaten nach potenziell antimikrobiellen Verbindungen zu durchsuchen. Codex wird programmiert, um genomische Datenbanken zu analysieren und Sequenzen zu extrahieren, die Peptide oder Moleküle codieren könnten, die gegen antibiotikaresistente Bakterien wirken. Anschließend dient ChatGPT als konversationeller Assistent, der Hypothesen formuliert, Ergebnisse interpretiert und Validierungsversuche im Vitro entwirft. Dieser Ansatz verbindet die enorme Datenverarbeitungsfähigkeit genetischer Informationen mit der Erzeugung von Ideen und Erklärungen in natürlicher Sprache und beschleunigt die Identifizierung vielversprechender Kandidaten, die sonst monatelang manuell ermittelt werden müssten. Erste Tests haben mehrere Moleküle entdeckt, die gegen hochriskante bakterielle Stämme aktiv sind, obwohl sie sich noch in der Vorstudie befinden.

Die Forschung ist von Bedeutung, weil die Antibiotikaresistenz eine wachsende Bedrohung für die öffentliche Gesundheit darstellt. Die Integration von KI‑Werkzeugen könnte die Zeit für die Entdeckung neuer Therapien erheblich verkürzen. Darüber hinaus zeigt das Projekt, wie KI die Reichweite der synthetischen Biologie erweitern kann, indem sie den Zugang zu genetischen Ressourcen ermöglicht, die zuvor unzugänglich waren.

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